故事依旧围绕斗龙战士的冒险、友爱、热血的战斗精神展开叙述，通过宝贝龙拍档和原始恐龙之间的经历和磨炼，以及斗龙战士之间的情感变化，多角度的弘扬斗龙精神，让孩子们体会成长中遇到的挫折和变化，让人类向原始恐龙学习来自原始恐龙世界的美德，共同为创建人类更美好的未来而努力。

故事讲述在22世纪的人类世界，一只身份来历不明的火恐龙横空降落在洛小熠等六名斗龙战士的生活城市，相继吸引了阿迪和六大守护龙前来人类世界，为了追踪火恐龙真相，阿迪与斗龙战士被不明光圈吸到另一个空间—阿莱达星基地。斗龙战士在阿莱达得知火恐龙出现人类世界的原因，为了阻止这些给人类世界带来危险的恐龙，斗龙战士肩负起维护正义和平使…

热爱电脑游戏的主人公天乐与它的宝贝龙神秘去到了斗龙世界，忠于科学研究的安小达得知斗龙世界掌握了人类的命运，安小达与汪美含抱着坚定的决心与强烈的好奇心去往斗龙世界...

会突然出现接二连三的反常现象：人类的世界惊现原始恐龙，阿莱达星兽基地被恐龙凶兽龙始祖入侵等等，这一桩桩怪事为何发生，答案竟和龙源纪的一道镇守令——龙的密令遗失相关。斗龙战士们将如何对抗这股来路不明的黑暗力量，他们将会面对怎样的重重磨难，人类世界能否回归和平，带着这一系列的疑问，斗龙战士们，开启新的旅程吧。

在第四部的结局中，撒旦魔龙虽被打败，可是阿迪却出现了异常的表现，这到底暗示了什么？第五部将续写斗龙战士们的冒险征程，并解答未知的疑团。