杀人越货的罪犯连续神秘死亡，人们将替天行道惩治恶人的基拉奉为救世主，警方对之束手无策。专门解决奇诡事件的天才少年L推断，基拉有97%的可能性身在日本，于是他离开洛杉矶飞赴日本。临行之前，L心中浮起淡淡的预感——自己可能再也回不来了。

夜神月设计除掉了女友和跟踪自己的FBI的探员，趁机混进了调查本部，但是，L对他的怀疑并没有结束，新一轮的智力游戏继续进行。月和L的头脑对峙迎来了新的局面。借着“帮助ICPO逮捕Killer”的理由，月潜入了调查本部。这样月就和对月虎视眈眈的L直接面对面的交锋了。但是，发生了月预想以外的事件，与死神硫克个性迥异的另一位死神雷姆也把自己的…

一个名叫琉克的死神把一本“死亡笔记本”遗落在了人间，被就读于名牌大学东应大学的尖子生夜神月（藤原龙也饰）拾到了。这位被寄予厚望、将来能成为警视总监的天才，却暗暗感到所谓法律的正义是有界限的。就在这时，这本黑色封面的笔记本出现在了月面前，本上有这样一句话：名字被写在笔记本上的人都会死。月虽然不相信但还是随手写上了从电视上…